嘉兴市第三中学建校于1928年，前身系意大利天主教会创办的“明德女子中学”， 1951年7月，更名为私立明德初级中学，开始“扩充名额，男女兼收”。1952年被命名为“嘉兴三中”，校址在中山路134号（现为旭辉广场）。2002年8月，学校搬迁到环城南路611号（现为嘉兴实验初级中学教育集团），并于2004年开始初高中分离；三中初中和原洪波中学初中组建成“嘉兴初级实验中学”，三中高中部成为“嘉兴市第三中学”。2009年8月，嘉兴市第三中学搬迁至嘉兴市双溪路1922号高中园区内，占地155亩。

学校自创办以来，培养学生三万余人，校友遍布世界各地，各行各业，他们中有：美国耶鲁大学终身教授、遗传学家许田，知名商人、加拿大女皇金禧勋章获得者詹建龙，北京法国电信研发中心的首席执行官王海拉，中国十大服装设计师祁刚，书画家凌加春，全运会双冠王赵婧等。

在八十多年时代风雨变迁中，学校求生存、求发展、求创新，创造了一次次的辉煌。1980年学校被定为嘉兴县重点中学，2004年秋被评为浙江省三级重点高中，2007年春顺利晋升为浙江省二级重点高中。2011年4月，正式挂牌嘉兴教育学院实验中学。2012年1月，被评为浙江省文明单位。此外，学校还是浙江省体育特色学校，浙江省新课程样本学校。

学校有一支高素质的教师队伍，教职员工141人，专任教师128人，其中中学高级教师51人，中级教师58人。嘉兴市名校长培养人选1名，嘉兴市名教师2名，嘉兴市级学科带头人3名，嘉兴市属级学科带头人6人。学校现有36个教学班，学生1737名。

学校紧紧围绕“明德•健康”的培养目标，以“明志厚德”为基，“发展青年身心，培育优良秉性”，培养学生“明德的高尚品格，健康的身体素质，健康的心理状态，健康的智能活动，健康的审美感受，健康的生活情趣”，致力实现“满足学生有个性地健康发展”的办学理念。在浙江省深化课程改革的广阔背景下，学校构建了特色鲜明的“必修课+明德五健选修课”的课程结构，实现“明德五健，健康发展” 的育人模式转变，学校开设了近100门选修课程，满足学生多样化、个性化选择学习的需要，为学生的科学成材创造了多元发展的平台。学校积极推进现代学校制度改革，教育内涵不断丰富，教育管理不断科学，教学质量稳步提升。厚重的文化历史承载着现代教育的文明，先进的育人理念演绎着莘莘学子的精彩，“高质量、有特色的百年名校”是嘉兴三中不懈的追求。